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您现在所在位置:首页 > 期刊导读 > 2010 > 04 > 信息摘要

PCA3基因启动子多态性快速分型的DHPLC法建立

【出 处】:

【作 者】:

【摘 要】目的建立DHPLC技术分析PCa特异性PCA3基因启动子多态性的技术平台。方法在PCA3基因启动子区域设计1对引物,以本室先前已经建立的11种(C2T6、C2T5、C3T5、C2T5/C2T6、C3T5/C3T4、C3T5/C4T5、C3T5/C2T5、C3T5/C2T6、C3T5/C1T8、C2T5/C3T4、C2T6/C2T7)已知多态性的PCA3基因启动子的克隆质粒为标准品,通过优化DHPLC检测体系,建立其多态性克隆质粒的标准图谱。采用完全随机设计,从200例病理确诊为PCa患者中选取147例,对其PCA3基因启动子的扩增产物进行DHPLC分析,比较各标本洗脱峰与标准克隆质粒的DHPLC图谱,以判断临床标本PCA3基因多态性类型,并对这些基因型再行克隆测序予以验证。结果通过克隆质粒优化DHPLC检测体系,最适检测体系为:含44.3%A洗脱液(0.1mol/L TEAA、0.025%ACN)和55.7%B洗脱液(0.1mol/L TEAA、25%ACN)的起始洗脱梯度,含35.3%A洗脱液和64.7%B洗脱液的终止洗脱梯度,柱温53℃,流速:0.9ml/min,在该条件下DHPLC用8种杂合型克隆质粒(C2T5/C2T6、C3T5/C3T4、C3T5/C4T5、C3T5/C2T5、C3T5/C2T6、C3T5/C1T8、C2T5/C3T4、C2T6/C2T7)进行重复性验证,结果显示,同一多态性色谱峰中2峰的出峰时间之差的批间CV值在0%~6.67%之间。11种克隆质粒多态性标本仅通过1~2次洗脱,就能根据峰型和各峰的出峰时间将其区分开。147例PCa患者中,144例DHPLC检测结果和克隆测序结果一致(Kappa=1,P=0.000),并出现3种新的峰型,经克隆测序验证为3种新的多态性(C3T5/C1T6、C2T5/C1T8、C3T5/C2T7)。结论成功建立的DHPLC分析PCA3基因启动子多态性的技术方法,可对PCA3基因启动子多态性进行基因型别鉴定。该方法具快速、准确、经济、高通量、重复性好、自动化等特点,为进一步研究PCa基因多态性提供了技术平台。

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