人类血小板抗原全套基因分型方法的建立与应用
【出 处】:
【作 者】:
许先国
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朱发明
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刘瑛
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洪小珍
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马开荣
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蓝小飞
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严力行
【摘 要】目的建立一种基于DNA扩增和测序分型(PCR sequencing—based typing,PCR—SBT)的人类血小板抗原HPA-1~HPA-16w的基因分型方法。方法从免疫多态性数据库中下载HPA-1-HPA-16w的全套HPA核酸序列,以Primer Premier 5.0软件设计引物,特异性扩增包含HPA—1a/1b到HPA-16aw/16bw多态性的核酸片段。通过调整引物序列和PCR条件获得单一的特异性扩增产物,PCR产物纯化后直接进行DNA序列分析并确定HPA基因型。通过对2份标准样本的HPA分型验证PCR-SBT方法的准确性;并利用PCR-SBT法对2008年度国际输血协会(ISBT)第14届国际血小板免疫学工作组提供的16份比对样本(包括6个含有基因突变的干扰样本)进行HPA基因分型。结果设计11对引物扩增和测序16个HPA系统。2份标准样本的HPA基因型分别为HPA:1aa/2aa/3ab/4aa/5ab/6aa./7aa./8aa/9aa/10aa/11aa/12aa/13aa/14aa/15aa/16aa和HPA:1aa/2aa/3aa/4aa/5aa/6aa/7aa/8aa/9aa/10aa/11aa/12aa/13aa/14aa/15aa/16aa。16份ISBT考核样本的256个HPA基因型结果清晰,其中HPA-1~HPA-6w、HPA-9w和HPA-15共8个系统的128个基因型结果与ISBT参考结果完全一致。结论建立了HPA-1~HPA-16w的PCR—SBT分型方法,结合高通量的DNA序列分析仪,具有简单、快速和准确的优点,适合于临床HPA全套基因分型,具有良好的应用前景。
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